蛋白质组学是bottom-up还是top-down
蛋白质组学与Bottom up和Top down是两种不同层次的概念,蛋白质组学是研究蛋白质组的组成及其活动规律的科学,而Bottom up和Top down是两种不同的蛋白质质谱分析策略。Bottom up即“自下而上”质谱策略,又称鸟枪法蛋白质组学,其特点是通过直接检测蛋白质酶解得到的肽段来实现完整蛋白质的鉴定,该方法将液相色谱技术与质谱技术结合起来,其分析思路先将蛋白质进行多重酶解得到小分子肽段,再利用液相色谱技术分离不同的肽段,最后将分离后的肽段进行质谱分析,根据质谱信号结合生物信息学分析手段鉴定各肽段,将各个肽段拼接成完整的蛋白质最终实现完整蛋白质的鉴定。常用的蛋白质质谱定量技术如Label Free、SILAC、TMT和iTRAQ等都是基于“自下而上”策略实现的。Top down即“自上而下”质谱策略,与“自下而上”质谱策略相反,该技术直接对完整的蛋白质进行分析,可以保留“自下而上”分析策略中大部分被破坏的具有不稳定结构蛋白质的特征。
百泰派克生物科技采用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪结合Nano-LC纳升色谱技术,提供Top down自上而下蛋白质组学与Bottom up自下而上蛋白质组学服务技术包裹,用于蛋白质鉴定、蛋白质测序、PTMs表征、蛋白质结构表征以及相对和绝对定量分析等,欢迎免费咨询。
相关服务:
基于Top down自上而下蛋白质组学
基于Top down自上而下法的PTMs表征
基于Top down自上而下法的蛋白质测序
Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定
基于Label Free的定量蛋白组分析
基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ,TMT,SILAC
