蛋白质n端测序edman降解法和质谱比对
蛋白质序列即氨基酸排列顺序是蛋白质重要的理化性质,对蛋白质种类鉴定以及高级结构预测等具有重要意义。随着生命科学技术的发展进步,先后涌现出了诸多蛋白质测序技术,可以大致将其分为质谱法和非质谱法,非质谱法主要包括Sanger法、Edman降解法、二硝基氟苯法、丹磺酰氯法、肼解法以及羧肽酶法等,其中Edman降解法是最常用的非质谱法。
质谱法和Edman降解法都可以用于蛋白质序列分析,但是二者在分析原理和可以测定的序列区域上具有很大的差别。Edman降解法是一种针对N末端氨基酸的测序方法,其通过三个连续的化学反应可以切下一个N末端氨基酸残基,并对该氨基酸进行鉴定,然后将少了一个氨基酸的蛋白质再次进行以上操作,如此循环,每次循环鉴定一个氨基酸残基。但是,末端修饰或封闭的氨基酸不能进行上述化学反应,因此,Edman降解法对N末端修饰或封闭的蛋白质无能为力。
质谱法利用质谱仪采集蛋白酶切后生成的肽段母离子的碎片信息,通过鉴定各肽段的氨基酸组成和序列实现蛋白层面的序列分析。相比Edman降解法,质谱法可以实现蛋白质的全长序列分析,还可以用于N末端发生修饰的蛋白质序列分析,打破了Edman降解法的局限性。此外,质谱法还可以进行从头测序,为测定全新的或者没有理论数据库的蛋白质序列提供了解决方法。
百泰派克生物科技采用岛津公司Edman测序系统以及Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台结合Nano-LC色谱,提供基于Edman降解法的蛋白序列测定以及基于质谱法的蛋白质序列分析服务技术包裹,可以对各种蛋白样品进行C/N末端测序、全长序列测定以及从头测序等,欢迎免费咨询。
相关服务:
基于质谱的序列分析
基于Edman降解的蛋白质N端测序
基于PCR扩增的单克隆抗体测序服务
从头测序
蛋白测序
多肽测序
抗体测序
蛋白质N/C端测序
生物制药N/C端测序
蛋白全序列测定
基于Top down自上而下法的蛋白质测序
