氨基酸序列重复片段分析
氨基酸序列重复片段是指蛋白氨基酸序列中的不同位置出现的相同或对称性氨基酸片段,这些氨基酸重复片段有着对应的相似的结构和单元,蛋白序列中的氨基酸重复片段对于研究蛋白质的结构、功能及其进化路径有着至关重要的作用。
蛋白经过基于Edman降解或质谱法序列测定之后,所得到的蛋白氨基酸序列经过数据库检索或从头测序的策略进行序列分析。在进行蛋白氨基酸序列重复片段分析时,需要借助算法、数据库或软件(如BioAider)等工具,并结合相应的生物信息学注释和分析技术,寻找或筛选出蛋白序列中存在的重复序列及其氨基酸序列长度。
百泰派克使用Thermo公司推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪提供蛋白测序服务,该服务可对蛋白样品的序列分析。Obitrap Fusion Lumos质谱仪是现在分辨率和灵敏度最高的质谱仪,保证了低丰度肽段碎裂片段鉴定的灵敏度;同时在肽段碎裂过程中采取HCD与ETD结合的模式,保证肽段碎裂片段的完整性。可以实现蛋白样品的N端,C端序列分析以及蛋白全长序列分析。
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