氨基酸从头测序

随着质谱技术的不断升级及其相关算法的日益优化，基于质谱检测数据的蛋白肽段的从头测序（De novo sequencing）技术也在逐步完善。氨基酸从头测序是一种不依赖于肽段已知氨基酸序列或氨基酸数据库数据，直接对蛋白氨基酸序列进行测定的全新测序技术。氨基酸从头测序可直接从质谱数据推测肽段氨基酸序列，无需与数据库中的理论氨基酸序列进行比对分析。从头测序技术与Edman降解法测序类似，均不依赖于理论数据库，可以对新的、未知的多肽氨基酸序列进行分析。且从头测序技术不受蛋白肽段的大小限制，可以直接根据质谱数据推断出60个氨基酸以上的肽段氨基酸序列。

百泰派克生物科技采用Thermo公司推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪结合Nano-LC纳升色谱技术，提供基于质谱的多肽de novo从头测序服务，对多肽序列进行分析。Obitrap Fusion Lumos质谱仪是现在分辨率和灵敏度最高的质谱仪，保证了低丰度肽段碎裂片段鉴定的灵敏度；同时在肽段碎裂过程中采取HCD与ETD结合的模式，保证肽段碎裂片段的完整性。得到质谱原始数据之后，采用从头测序的方式对多肽序列进行推导。