SWATH质谱产生的碎片离子如何对应到蛋白质？

一旦完成数据采集后成，每个离子的MS和MS/MS信息将映射到理论数据库中，以识别样本中存在的肽和蛋白质。这个过程可以通过多种算法完成，包括Mascot、OMSSA、ProteinPilot等。

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