2D-DIGE和液相色谱法谁更适合研究生物体蛋白质组的变化？

这一问题没有统一的答案，因为不同的方法适用性不同。要根据实际情况进行选择。比如你预计蛋白质水平（数量和水平）会发生什么样的变化？由于DiGE提供了样品的可视化并使用了内部标准，因此使用此方法可能更容易识别（小）变化。当然后续仍需要切除感兴趣的点来识别相应的蛋白质。其次你有多少材料可供分析？DiGE实验可能需要比基于LC-MS的实验更多的材料。总的来说，DiGE方法可视性强，以便更好地解释潜在差异（使用内部标准化），但需要通过质谱法进行后续蛋白质ID鉴定，而LC-MS可鉴定混合物中的蛋白质，但要找出样本之间的任何（细微）差异将更具挑战性。

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