与基于凝胶的技术相比，基于溶液的蛋白质组分析有什么优势？

如果您的样品复杂程度较低，我们建议您在 SDS-PAGE 凝胶上运行它们，以去除污染物和质谱干扰物质。只需短时间运行，让蛋白质混合物进入浓缩胶并浓缩为一个粗条带。但并非所有蛋白质都能在 SDS-PAGE 凝胶中得到很好的分离，尤其是膜蛋白。如果您使用与蛋白质组学兼容的裂解缓冲液制备复杂的细胞裂解物，那么在肽数量和蛋白质鉴定方面，基于溶液的样品比基于凝胶的方法可提供更好的结果。很多实验，例如下拉分析、蛋白质-蛋白质相互作用，其中起始材料和所得洗脱蛋白质浓度非常有限，可能无法进行基于凝胶的分析。在这些特殊情况下，我们建议直接使用胰蛋白酶处理的洗脱液进行质谱分析。请与我们讨论您的实验要求，我们很乐意为您提供正确的策略以获得成功的结果。

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