与MALDI-TOF/TOF相比，nano-ESI MS/MS有何优势？

我们利用色谱梯度根据肽混合物的疏水性分离它们。这降低了肽混合物的复杂性，并在机器运行期间执行数千次 MS 和 MS/MS 扫描。在 MS/MS 测序之前，机器有足够的时间在离子阱中富集肽。通过这种方式，不仅蛋白质的覆盖率会增加，而且能比 MALDI-TOF/TOF 产生更好的质量数据。在 MALDI-TOF/TOF 分析中，混合物中存在的所有肽在激光激发过程中同时飞行，操作员必须根据 PMF (MS1) 光谱手动决定需要对样品执行哪种 MS/MS。在我们的方法中，机器利用非常智能的自动化技术，如自动增益控制 (AGC) 和数据相关采集 (DDA)，对样品中尽可能多的肽进行测序。与现有的 MALDI-TOF/TOF 技术相比，我们提供更大的覆盖范围、更好的频谱质量和灵敏度。我们的技术非常自信地鉴定蛋白质、蛋白质复合物、PTM 修饰，比 MALDI-TOF/TOF 好得多。

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