应该选择非标记定量还是基于同位素标记的定量？

这个问题没有万全的答案。通常，非标记定量可用于任意数量的样品，有时可以更深入地覆盖蛋白质组。然而，这更多地取决于仪器条件，因此所有用于定量分析的样品都应按顺序运行。基于同位素标记的定量（包括 SILAC 或 iTRAQ 或 TMT 等基于报告的技术）所需的仪器时间要少得多，并且由于样品同时运行，因此可以轻松直接比较样品。然而，研究设计受到可用同位素标签数量的限制。这两种策略本身没有哪种更好，因此您应该仔细考虑哪一种最适合您的特定实验。



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