是否有可能从蛋白质组学数据中检测特定的氨基酸序列?
如果你在数据库搜索中找到了你的蛋白质,你可以检查的是MS数据的序列覆盖率,看看是否只有发生切割的地方的覆盖率。如果您的切割蛋白可以在切割位点产生特定的肽,可能您可以使用SRM,前提是可以检测到这种小肽(如果在数据库搜索中检测到,则更好)。
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