为什么我们应该从SDS-聚丙烯酰胺凝胶中制备蛋白质样品用于质谱分析？

这是一种在大规模生产之前降低样本复杂度的方法。通常比单独的Shotgun方法提供更大的覆盖深度和更多的ID。可以将其视为类似于离子交换分馏，即对每个馏分单独运行MS/MS，然后在最后合并数据以获得该样本的总体光谱信息。在这种情况下，你不是通过电荷来分离蛋白质或肽，而是通过相对质量来分离它们

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