质谱分析前是仅使用胰蛋白酶来消化蛋白质，还是可以使用其他蛋白水解酶？

如果要将样品“溶液中消化”，可以使用测序级蛋白水解酶的任何一种或组合。对于“凝胶内消化”，可使用的蛋白水解酶变得稍微有限。需要注意的是，许多高分子量酶对凝胶内消化的效率不如胰蛋白酶和糜蛋白酶。

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