什么是染色质免疫沉淀?

    染色质免疫沉淀被用于研究蛋白质和 DNA 之间的关系。该技术将 DNA 测序技术与免疫沉淀相结合,以识别 DNA 相关蛋白的结合位点。在 CHIP 分析期间,细胞用甲醛处理,甲醛是一种固定 DNA 与蛋白质相互作用区域的交联剂。接下来,在超声波仪或酶消化法的帮助下,细胞被裂解,染色质被分解成小片段。接下来是免疫沉淀,它使用对靶蛋白或修饰组蛋白特异的抗体。免疫沉淀完成,交联的化合物得到逆转并获得纯化的 DNA。接下来遵循几个下游过程来确定与蛋白质相互作用的基因组区域。靶蛋白结合的基因组区域的相对丰度通常通过标准化 PCR 方法进行鉴定。实时定量 PCR 也经常被用于准确定量测定富集位点。在很多情况下,CHIP 与微阵列相结合,即CHIP on chip 法,被用于对 DNA-蛋白质相互作用进行全基因组分析。


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