免疫沉淀有哪些不同的类型?
单个蛋白质免疫沉淀:该方法涉及从溶液中存在的几种其他蛋白质中分离出一种蛋白质。样本范围包括动植物细胞粗提物、体液。在单个蛋白质免疫沉淀中,目标蛋白质是已知的,并且特异性的抗体被用于分离该蛋白质。 蛋白质复合物免疫沉淀:该方法包括免疫沉淀含有抗原和相关蛋白质或与其结合的配体的复合物。蛋白质复合物免疫沉淀也称为共免疫沉淀,当n复合物中存在几种蛋白质并且其成员之一已知时,则可以借助在能够结合已知成员的抗体基础上识别未知蛋白质。当蛋白质复合物的成员相互连接时,更容易将整个复合物分离并识别未知成员。这种方法有时也称为下拉(pull down)。 染色质免疫沉淀:染色质沉淀或 CHIP 是识别细胞内蛋白质和 DNA 相互作用的方法。该方法用于了解哪些基因组区域与特定蛋白质相关,或者几种蛋白质是否与特定基因组区域相关。CHIP 测定还可用于识别启动子区域中蛋白质的募集顺序或特定基因组区域的组蛋白修饰。此外,CHIP 还提供与转录因子结合相关的信息。 RNP免疫沉淀:受核糖核蛋白复合体调控的基因表达是转录后调控的。核糖核蛋白复合体包括 RNA 结合蛋白和非编码 RNAs,它们一起调节细胞功能,例如剪接、mRNA 的稳定性、出核或蛋白质定位。同样,对特定细胞过程的蛋白质合成起作用的 mRNA 被发现与形成 mRNP 的核糖核蛋白复合体有关。这些对 RNA 功能至关重要的 RNA 结合蛋白也是潜在治疗选择的重要靶点。因此,在针对 RNA 结合蛋白的抗体的帮助下,RNP 免疫沉淀或 RNP-IP 可用于从核糖核蛋白复合体中分离 miRNA、mRNA。
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