糖基化位点会抑制蛋白质的鉴定吗？

如果蛋白质的纯度和浓度很高，那么在大多数情况下，基于质谱的蛋白质鉴定仍然是有利的。然而，连接的碳水化合物 (CHO) 链会通过以下机制削弱特定肽段的基于质谱的鉴定：1) CHO 链可以阻断胰蛋白酶切割；2) 连接的 CHO 链的可变质量会降低糖肽检测。建议：在凝胶上样和质谱分析之前，用 N-聚糖酶 (PNGaseF) 切割 N-连接的 CHO 链。

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