你们能鉴定出带有翻译后修饰 (PTM) 的特定氨基酸吗？

可以，使用质谱可以在给定的肽序列中确定 PTM 的确切氨基酸位置。然而，这取决于光谱的质量、给定磷酸肽的检测碎片离子（无论它们是否是位点决定的）以及 PTM 类型（如果 PTM 位点确定成功且可靠）。在典型的磷酸蛋白质组学分析中，通常约 60% 的已鉴定 S、T 和 Y 磷酸化位点可以高置信度地确定到特定的氨基酸位置。

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