进行SWATH数据处理时如何建立离子数据库？

1、利用信息依赖采集法(IDA)通过采集样品数据建立离子数据库，经ProteinPilotTM软件或其它的搜素引擎鉴定到的蛋白即为SWATH数据处理时的离子数据库；2、借助生物信息学方法对来自于外部数据库的二级质谱数据进行靶向蛋白分析，同时创建离子数据库。

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