您排除重复肽的依据是什么?
我们仅根据它们是否出现在FASTA文件中的多个FASTA序列中来排除 "重复" 肽。Skyline还具有更复杂的独特肽选择机制,您可以使用背景蛋白质组来选择基因特有的肽(这不是这里使用的)。如果您改为使用删除“重复”肽段,则 Skyline将在文档中保留每个唯一肽段的单个副本,但请确保它仅代表一次,并且该单一时间将是它第一次出现在导入的蛋白质。这可能不一定在定量上有用,因为您真的不知道哪种蛋白质贡献了您决定靶向的共同肽的多少,不确定您建议的值如何与重复或唯一性相关。
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