Nano LC-MS 用于蛋白质鉴定的优势是什么？

Nano LC-MS 在蛋白质鉴定方面比 MALDI-TOF MS 更灵敏有两个主要原因。首先，由于肽的质量和每个肽的两个系列片段都存在，即使消化物中低至一个肽也可以鉴定蛋白质。相比之下，基于 MALDI-TOF 的蛋白质鉴定只能确定肽的质量；因此，它需要检测大量的肽才能实现高可信度的蛋白质鉴定。其次，在基于 MALDI 的 MS 分析过程中，通常只有很小百分比（通常为 1/1000 到 1/10000）的肽分析物被使用。这两个因素的结合使 LC-MS 技术比基于 MALDI-TOF 的 MS 技术更加灵敏，尽管基于 MALDI -TOF 的蛋白质鉴定的通量比基于 Nano LC-MS 的蛋白质鉴定高数百倍。Nano LC-MS 在蛋白质鉴定中的另一个重要优势是它能够分析非常复杂的混合物，因为样品中的肽在 MS 和 MS/MS 之前通过 HPLC 分离。因此，如果该蛋白质的一个或多个肽在整个 LC 分离过程中没有被其他肽完全掩埋，即使是蛋白质混合物中的一小部分也可以被鉴定出来。相比之下，多肽混合物在 MALDI-TOF 分析过程中没有分离，因此几乎不可能鉴定出蛋白质混合物中的小部分蛋白质，甚至很难判断基于MALDI-TOF 的蛋白质鉴定过程中是否遗漏了某些蛋白质。当用SDS-PAGE代替2D凝胶制备样品时，这一问题变得非常严重，因为在大多数微尺度蛋白纯化过程中，多个蛋白在一个凝胶带内共迁移往往是规律而不是例外。



相关服务:
• 蛋白鉴定