如果文库测量中不包含iRT肽,可能发生的最坏情况是什么?
我们不建议在没有某种形式的保留时间预测的情况下尝试使用mProphet峰值检测。其他指标似乎不足以在全梯度色谱图上表现很好,并且在没有保留时间预测来源可用时,其本身提取过程要慢得多且生成的文件要大许多。这并不意味着您无法通过使用内源性肽作为iRT标志物来预测保留时间。因此,您的库测量不需要包含注入的标准,也不需要预先考虑如何确定iRT内标。Skyline可以从内源性肽中得出这一结果,尤其是如果您有真核生物样品(Parker、MCP等)可对CiRT 肽进行了高质量测量。
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