DIA和DDA两者优缺点是什么？另外：建议使用MSconvert或任何其他软件进行转换吗？或者建议的设置吗？

转换是通过使用质心来减小文件大小。为了保持一致性，DIA 文件最初也是 mzXML 格式。然而，mzXML比 mzML丢弃更多的信息，在这种情况下，mzXML没有编码隔离窗口的办法，而只有一个前导质荷比（m/z），它可能是隔离窗口的中心，但在某种情况下如果您有 64 个可变隔离窗口，则隔离窗口的宽度也是关键信息。出于这个原因，我们将数据重新转换为mzML格式，这使我们能够简单地从文件中导入隔离方案，这对于mzXML格式而言是不可能的。然而，在您自己的工作中，我们建议您倾向于使用仪器供应商的本地数据格式，并避免转换，因为转换会增加数据处理的额外时间和空间要求。

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