当样品中未添加iRT mix时，您如何将Skyline应用于DIA技术？

Skyline支持使用内源性肽作为iRT标准，Skyline一个很好的起点是使用CiRT肽——一组已发表的80多种存在于真核生物中的保守肽。Skyline将自动选择其中的一个子集，这些子集在在数据中可以很好地表达。曾有研究在2个体系中含3种生物有体混合数据集上取得了成功，一个是人类、酵母、大肠杆菌混合数据集，另一个是耶氏酵母（Yarrowia）、拟南芥菌（Arabidopsis）、链球菌（Streptococcus）混合数据集。但是，您也可以通过Skyline在您的数据中找到高质量的内源性标记，如果您在没有iRT预测的情况下以全梯度模式提取目标的重复运行，这需要更多的准备但确实有效。

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