对于未知蛋白质，如果蛋白质的N端环化或N端有未知修饰，如何准确分析蛋白质序列？

对于序列未知的蛋白质，尤其是工程重组蛋白质、体外合成蛋白质、工程抗体，或基因序列尚未研究过的蛋白质，其信息往往不包含在蛋白质数据库中。为了实现对此类蛋白质序列的准确分析，必须使用蛋白质从头测序。蛋白质从头测序是一种基于质谱的分析方法。与传统的质谱方法类似，从头测序法也是先将蛋白质切成小的多肽片段，然后通过高效液相色谱分离多肽片段，再通过两级质谱确定多肽片段的序列。与传统的质谱测序相比，从头测序是一种精确的算法，可以保证识别出的多肽序列能够高精度地推导蛋白质序列，无需依赖数据库比对即可实现蛋白质从头测定。

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