我在质谱结果中发现了一些可能的相互作用物（目标蛋白质复合物的潜在组分或目标蛋白的结合体），接下来需要做什么来确认这些蛋白质？

下一步最好是开展重复性实验，确认我们是否可以重复地确认得到初始结果。需要一式三份（用于实验和控制条件）以获得良好的统计基础并计算倍数变化和相关的p值。为了更好地区分真正的相互作用物和背景蛋白质，这些值可以可视化为火山图进一步分析。

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