生信分析中序列覆盖率(Sequence coverage)是什么?

    序列覆盖率((Sequence coverage))是识别蛋白质中氨基酸数量的百分比值。 如果鉴定的肽在1.000个氨基酸长的蛋白质中覆盖200个残基,则序列覆盖率为 20%。序列覆盖率可以从0%到100%不等,通常不会在样品中检测到所有属于蛋白质的肽段。这取决于许多因素,例如蛋白质序列、蛋白质长度、样品中的丰度、样品的复杂性等。 已识别(覆盖)的氨基酸以绿色突出显示,经修饰鉴定的氨基酸以红色突出显示,黑色则表示氨基酸没有被识别。


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