基于Illumina的RNA-Seq与PacBio上的Iso-Seq相比如何？

一般来说，当对定性终点感兴趣时，Iso-Seq优于Illumina方法，例如选择性剪接、选择性多聚腺苷酸化、基因组注释和新转录本检测。对于定量评估（例如，一个样本中转录本A与B的表达，或样本1与样本2中转录本C的表达），推荐使用短读方法，因为可以获得更多的读取次数。

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