基于Illumina的RNA-Seq与PacBio上的Iso-Seq相比如何?

    一般来说,当对定性终点感兴趣时,Iso-Seq优于Illumina方法,例如选择性剪接、选择性多聚腺苷酸化、基因组注释和新转录本检测。对于定量评估(例如,一个样本中转录本A与B的表达,或样本1与样本2中转录本C的表达),推荐使用短读方法,因为可以获得更多的读取次数。


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