SWATH定量—SWATH采集通过依次分析窗口来获取数据。通常情况下,数据是如何获取的?

    通常情况下,或在IDA模式下,数据是在调查扫描后获得的。调查扫描确定了40个最强的离子,并且只对这些离子进行破碎。这意味着在固定的时间点,唯一被碎片化的离子是选定的最强烈的离子。在SWATH的1个周期内,所有窗口都是按顺序获取的。例如:假设我们想要覆盖从 350-1250 m/z 的一系列离子。 窗口 #1 的范围可以从 350-352.4 m/z。质谱仪将碎裂所有适合此窗口的离子(强或不强)。结果将是与 350-352.4 m/z 窗口内的所有前体相关的 MS/MS 片段的混合。然后,质谱仪将从窗口 #2 分离和破碎离子,例如从 352.4 到 356.1 m/z 并记录它们的 MS/MS 碎片,依此类推,直到第 200 个窗口。


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