SWATH定量—是否可以通过将结果映射到理论数据库上将离子与蛋白质联系起来?该映射是由MS/MS鉴定软件完成的吗?
可以,一旦IDA运行完成,每个离子的MS和MS/MS信息都被映射到一个理论数据库中,以确定样品中存在的肽和蛋白质。这个过程可以通过几种算法完成,包括Mascot、OMSSA、ProteinPilot或多算法界面,如搜索GUI。
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