应该如何准备2D电泳的样品进行质谱分析？

首先，重要的是要知道2D PAGE的蛋白质样品不应含有高盐浓度，SDS等离子洗涤剂或细胞裂解产生的细胞碎片和DNA。这些会干扰等电聚焦（IEF）并导致凝胶中出现斑点条纹。确保蛋白质浓度约为1-20ug /ul。对于含有许多蛋白质的复杂样品，每个凝胶上的蛋白质上样量应约为50-300微克，纯蛋白质样品的蛋白质上样量应约为5-50微克。此外，对于通过质谱鉴定蛋白质，凝胶可以通过标准的考马斯染色方法或通过针对MS蛋白质ID优化的更灵敏的银染色方法进行染色。

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