为什么选择差异凝胶电泳2D-DIGE进行定量蛋白质组学分析,而不是2D凝胶?
在2D-DIGE(two-dimensional difference gel electrophoresis差异凝胶电泳)中,我们使用荧光染料对蛋白质进行标记,从而能够在一张凝胶中进行3个样品的测定。与传统的2D凝胶相比,2D-DIGE有许多优势: 更高的灵敏度:荧光染料的灵敏度为0.2ng/spot,而考马斯的灵敏度为100ng/spot,而银染色的灵敏度为1ng/spot。 更高的准确度:极高的点分辨率可实现准确的点定量。可检测到小至10%的蛋白质表达差异 更高的重现性:在同一凝胶上或跨不同凝胶上用不同Cydye标记的同一样品上获得几乎相同的数据,从而消除了运行技术重复的需要。 更广的光谱:每张凝胶可以分辨约5000个蛋白质点,允许对低丰度蛋白质、大蛋白质和小肽进行宽动态范围的检测/定量。 使用更少的胶条:每块凝胶最多可容纳3个不同的样品。
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