靶向蛋白质组学和非靶向蛋白质组学

蛋白质组学根据研究目标是否是针对特定的蛋白质可以分为靶向和非靶向蛋白质组学。靶向蛋白质组学,针对特定的目标蛋白质进行研究;非靶向蛋白质组学,针对全局检测尽可能多的蛋白质。百泰派克生物科技提供基于质谱的靶向蛋白质组学和非靶向蛋白质组学分析服务。

非靶向蛋白质组学也称为发现蛋白质组学,旨在发现并检测样品中更多的蛋白质,从而发现新的蛋白质和生物标志物等。非靶向蛋白质组学的出现早于靶向蛋白质组学,适合于生物标志物发现的早期研究阶段。基于质谱的非标记(Label Free)定量蛋白质组学、SILAC定量蛋白质组学、TMT/iTRAQ定量蛋白质组学,以及SWATH定量蛋白组学等都属于非靶向蛋白质组学。

靶向蛋白质组学和非靶向蛋白质组学

Bostanci N, et al. Molecular & Cellular Proteomics, 2018

在非靶向蛋白质组学研究中发现感兴趣的特定蛋白质或生物标志物之后,可进一步通过靶向蛋白质组学的方法,在更多的样本中验证和研究这些蛋白质。相比于非靶向蛋白质组学,靶向蛋白质组学有更好的准确性、灵敏度和重现性。靶向蛋白质组学技术主要包括MRM(multiple reaction monitoring)和PRM(parallel reaction monitoring),其中MRM也称为SRM(selected reaction monitoring),它们可以更灵敏的检测低丰度的多肽片段并有更高的定量精度,从而验证和确认非靶向蛋白组学发现的蛋白质以说明生物学差异。

相关服务

基于SILAC的蛋白组定量
基于TMT/iTRAQ的蛋白质组定量
label free定量
SWATH技术
MRM/PRM定量蛋白组学分析

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