鸟枪法蛋白组学

鸟枪法蛋白质组学是基于液相色谱和质谱技术的一种分析蛋白质组的方法,摆脱了传统凝胶分离技术的局限和不足。百泰派克生物科技提供鸟枪法分析蛋白质组的服务。

鸟枪法蛋白组学

鸟枪法(shotgun)蛋白质组学是指将自下而上(bottom-up)的蛋白质组学技术结合使用高效液相色谱与质谱联用来鉴定复杂混合物中的蛋白质。该名称源于DNA的鸟枪法(shotgun)测序。鸟枪法蛋白质组学最常用的方法是从消化混合物中的蛋白质开始,然后通过液相色谱法分离得到的肽段,接着使用串联质谱法鉴定肽段。鸟枪法蛋白质组学允许鉴定样品全部蛋白质,并具有系统分析动态蛋白质组的能力。它还避免了与完整蛋白质分析相关的中等分离效率和较差的质谱灵敏度。常见的label free、SILAC和iTRAQ定量蛋白质组学分析都是基于鸟枪法进行的。

鸟枪法蛋白组学流程

鸟枪法蛋白组学实验中,首先是从样品中提取蛋白质,并用蛋白酶消化以产生肽段混合物。然后将肽混合物直接上样到液相色谱柱上进行分离,分离后的肽段经电离成为离子,最后进入串联质谱(MS/MS)进行解析。利用计算机根据设定好的运算法则分析所得数据,可以从理论蛋白质数据库中检索出测得的肽段对应的蛋白质,从而确定样品中的蛋白质成分。

鸟枪法蛋白组学

鸟枪法蛋白组学

相关服务:

定量蛋白组分析
基于Label Free的定量蛋白组分析
基于SILAC/Dimethyl标记的定量蛋白组分析
TMT/iTRAQ/MultiNotch定量蛋白组学分析

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