你有体内sumo化测定的protocol吗?应该是需要特殊的裂解液
- 通过离心等方法清除细胞碎片,收集含蛋白的上清。
- 采用亲和层析法(如镍柱或抗SUMO抗体柱)纯化SUMO化蛋白。
- 对消化后的肽段进行洗涤和浓缩。
- 通过离子交换色谱、亲和色谱或液相色谱等方法进一步纯化。
- 使用液相色谱与串联质谱(LC-MS/MS)进行肽段的分离和鉴定。
- 选择合适的质谱仪器和方法(如ESI或MALDI,依赖于样品和仪器)。
- 使用质谱数据分析软件(如MaxQuant, Proteome Discoverer等)进行数据处理。
- 利用数据库搜索引擎(如Mascot, SEQUEST等)对MS/MS数据进行搜索,以鉴定和定量SUMO化位点。
体内SUMO化测定技术通常涉及以下几个关键步骤:
1.细胞裂解:
使用一种特殊的裂解液来破坏细胞膜,释放出细胞内的蛋白质。这种裂解液通常含有一些特殊成分,比如蛋白酶抑制剂、磷酸酯酶抑制剂和SUMO特异性蛋白酶抑制剂,以保护SUMO化蛋白质不被降解。
2.蛋白质提取和纯化:
3.蛋白质消化:
用胰蛋白酶(Trypsin)或其他蛋白酶在适当的条件下消化蛋白样品,以生成肽段。
4.质谱样品准备:
5.LC-MS/MS分析:
6.数据处理和分析:
7.生物信息学分析:
分析SUMO化肽段和蛋白质,包括定位SUMO化位点和鉴定潜在的功能。
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