请问如何制备磷酸质谱的样品呢
磷酸化蛋白的样品制备对于后续的质谱分析是至关重要的,其大致步骤如下:
1. 蛋白提取:
(1)使用适合的缓冲液从细胞或组织中提取总蛋白。
(2)为防止蛋白酶的活性,可加入蛋白酶抑制剂。
(3)为防止磷酸化位点在提取过程中丧失,使用磷酸酯酶抑制剂是很重要的。
2. 蛋白纯化和浓缩:
(1)可通过超滤、离心等方法进行蛋白浓缩。
(2)也可以使用免疫沉淀或亲和层析进一步纯化特定的蛋白或蛋白复合体。
3. 蛋白酶消化:
通常使用Trypsin进行蛋白酶消化,将蛋白分解为肽段。
4. 磷酸化位点富集:
由于磷酸化蛋白或肽段在样品中的丰度通常很低,因此需要通过亲和层析方法(如金属螯合层析或免疫沉淀)富集磷酸化肽段。
5. 液相色谱分离:
使用高效液相色谱(HPLC)进行肽段的进一步分离和洗脱。
至此,得到的肽段就可以进行质谱上样了。
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