怎么看哪个蛋白差异显著？

要寻找显著差异的蛋白质，通常需要利用生物信息学方法进行差异表达蛋白质分析，常用的生信统计方法如t检验、方差分析、Wilcoxon等，这些方法将产生每个蛋白质的差异表达值（例如，fold change，log2(fold change)等）以及统计显著性指标（如p-value或校正后的p-value）。

接下来最重要的一步就是根据研究的要求和标准，设置显著性阈值，一般来说，较常见的选择是设置调整后的p-value阈值（如0.05或0.01）或fold change阈值（如2倍或1.5倍），如果得到的p-value小于显著性水平，就可以认为蛋白质表达差异显著。

为了确保结果的可靠性，通常需要进行独立的重复实验或采用其他方法进行验证如Western blotting。

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