发生修饰的蛋白，电泳跑胶两条带，蛋白质谱显示两条带匹配上的肽段相同，怎么看发生了什么修饰？

根据您的描述，电泳跑胶显示了两条带，而蛋白质谱表明这两条带的肽段相同。这很可能意味着这两条蛋白质带之间存在某种翻译后修饰（PTM，Post-Translational Modification）。

 

要确定具体发生了哪种翻译后修饰，您需要进一步分析蛋白质谱数据。以下是一些建议的步骤：

 

1、检查质谱图：

详细分析质谱图上的离子信号，看是否有修饰引起的质量偏移。例如，磷酸化会使氨基酸残基的质量增加80 Da，乙酰化会增加42 Da等。这可以帮助您确定可能的修饰类型。

 

2、使用软件工具：

一些生物信息学软件可以帮助您分析蛋白质谱数据，以确定翻译后修饰。这些软件通常需要输入原始质谱数据，并可以设定搜索修饰的类型。软件将根据质谱数据为您提供可能的修饰。

 

3、对照实验：

设计实验以验证您的观察。例如，如果您认为发生了磷酸化，可以使用特异性磷酸化抗体进行免疫印迹验证。或者，您可以尝试使用磷酸酶处理蛋白样品，看是否能消除修饰。

 

4、文献调查：

查阅相关文献，了解该蛋白是否已知存在某种翻译后修饰，以及修饰发生的环境条件和生物学功能。这将帮助您将观察到的修饰与现有知识联系起来。

 

通过这些分析方法，您可以更好地了解发生了哪种翻译后修饰。

 

北京百泰派克生物科技——生物药物表征，多组学生物质谱检测优质服务商

 

相关服务:

凝胶及图像分析

蛋白质质谱鉴定

翻译后修饰蛋白组分析