肝脏组织此前置于液氮保温桶中保存,但未及时处理,今天才发现。请问目前仍可用于蛋白提取吗?
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整块组织通常比匀浆/裂解液状态更稳定。
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若组织已切碎、且装管不严导致吸潮结冰,也会增加后续处理的变异。
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WB检测丰度较高的结构/代谢蛋白:通常可用。
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磷酸化/乙酰化等PTM、蛋白互作(Co-IP)、定量蛋白组学:对冻融和微量降解更敏感,需要更严格质控。
一般情况下,仍然可以用于蛋白提取,前提是该肝组织在液氮保温桶中始终保持深度低温(接近 -196 °C)且未发生融化/反复冻融。液氮条件下蛋白酶与磷酸酶活性基本被“冻结”,对总蛋白回收与多数下游检测通常影响很小。
一、需要先判断的关键点(决定“能不能用/能用到什么程度”)
1、是否有融化迹象或冻融历史
若样本曾出现软化、表面潮湿、结霜融水、离开液氮后明显“回温”、或不确定是否经历过冻融:总蛋白仍可能提取,但降解风险上升,尤其影响低丰度蛋白、蛋白修饰(如磷酸化)、以及长条带/大分子蛋白的完整性。
2、保存方式
3、下游目的
二、建议的最小化风险操作
1、全程低温快速处理:取样、称量、剪碎/研磨都尽量在液氮或干冰上完成,避免“半融化”。
2、使用强抑制体系:裂解液中加入蛋白酶抑制剂 + 磷酸酶抑制剂(若做PTM必加)。
3、优先选择机械破碎:液氮研磨成粉后再加裂解液,减少局部升温时间。
4、分装避免二次冻融:提取后的蛋白按一次用量分装,-80 °C保存。
三、提取后快速质控
1、BCA/Bradford:确认总量是否异常偏低。
2、SDS-PAGE考马斯染色或WB内参(GAPDH/ACTB/Tubulin):看是否出现明显“拖尾/低分子涂抹”提示降解。
3、如做磷酸化:跑一个已知磷酸化标志蛋白或用p-Ser/Thr/Tyr抗体做整体评估。
四、结论与可执行建议
1、若确认样本一直在液氮中、未融化:可以按常规方案进行蛋白提取,成功概率很高。
2、若可能发生过融化/冻融:仍可提取,但建议把该样本作为“风险样本”处理,务必做上述电泳/内参质控;若用于定量蛋白组或PTM研究,建议谨慎解释结果或尽量更换样本。
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