粪便样本用于肠道菌群16S rRNA高通量测序,采集后可以直接置于–80°C冰箱保存吗?是否可以不经过液氮速冻?

    粪便样本用于16S rRNA高通量测序的目的在于最大程度保持肠道菌群的原始组成结构,避免因采集、运输和保存过程中的细菌代谢活动或DNA降解而引入偏差。针对该问题的简要分析如下:

    一、–80°C保存是否可行

    可以,–80°C直接保存是可接受的标准方法之一。

    多数肠道微生物组研究在采样后,将样本立即置于–80°C保存,可在数天至数周内保持菌群结构基本稳定。多个文献和实际操作均表明,–80°C冻存能很好地维持微生物群落的组成。

    二、是否必须液氮速冻

    不强制,但液氮速冻有助于提高样本质量,尤其适用于高敏感性或高通量研究。

    液氮速冻可实现瞬间降温,有效抑制细菌活性与DNA酶活性,有利于最大程度保持原始菌群状态。但在常规16S研究中,直接-80°C冻存已经足够稳定,特别是样本采集至冻存间隔不超过30分钟的情况下。

    三、推荐操作建议

    1、优先选择:样本采集后尽快转移至预冷的–80°C冰箱中。

    2、如现场条件受限(如野外采样):建议使用含有保存液的采样管(如OMNIgene·GUT等),可室温短时稳定。

    3、若目标为meta-transcriptome或高分辨率菌群研究:建议液氮速冻并长期–80°C保存。

    四、总结

    直接–80°C保存是可接受并常用的操作方式,不必强制使用液氮速冻。但如对数据质量要求极高,或采样至入库存在延时,液氮速冻可作为优化措施。

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    相关服务:

    16S/18S/ITS扩增子测序

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