为什么加了loading buffer并煮样后,放置于 -20°C保存,两天后上样时发现条带差异很大?
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若反复冻融,或保存时未即时速冻(如液氮或-80°C速冻后转入-20°C),容易导致蛋白变性或析出。
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某些蛋白在-20°C沉淀或部分不可逆聚集,影响条带完整性与迁移率。
出现此类条带差异,主要可能涉及以下几个方面的因素,建议按顺序排查:
一、样本降解或蛋白聚集
1、加样缓冲液(loading buffer)和煮样是否充分?
如果煮样不彻底(如温度不足或时间太短),蛋白可能未充分变性,导致保存过程中聚集、沉淀或部分降解。
2、是否含有蛋白酶抑制剂?
常规 SDS loading buffer 不含蛋白酶抑制剂,若样本本身蛋白酶活性高,在-20°C下仍可能发生部分降解,特别是冰箱频繁开关造成温度波动时。
二、冻融循环对蛋白结构影响
冻存方式是否合理?
三、SDS变性条件变化
1、SDS 可随时间析出或失活,特别是反复冻融后,其与蛋白结合能力下降,导致蛋白迁移异常或条带分散。
2、检查 loading buffer 是否新鲜配置,是否加入 β-ME 或 DTT,并在使用前充分混匀。
四、上样量与浓度不均一
保存后离心是否充足?
冷冻后上样前如未充分混匀或离心,易导致上样时取样不均,表现为条带强度或清晰度差异大。
五、建议
1、样本煮样后立即分装、速冻(液氮或 -80°C)保存,避免在-20°C长时间保存。
2、上样前先短时间高速离心并充分混匀。
3、视样本类型考虑在煮样前或buffer中加入蛋白酶抑制剂。
4、避免冻融循环。
5、尽量在煮样后当日上样,或采用原液冻存,临用前再加buffer煮样。
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