大鼠粪便冻存6个月用于制备混悬液,应直接-80°C冻存,还是加入甘油和PBS后再冻存?若加保护剂,混悬液如何准确称取粪便质量?
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适用情境:如用于代谢组学、部分基因组提取或非活菌相关研究。
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优点:样本成分不被稀释或引入外源成分,便于后续根据干重或湿重定量。
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缺点:细菌活性和微生物多样性在冻融过程中可能受损,不适合粪菌移植(FMT)等需保持活菌的实验。
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适用情境:若后续用于粪菌移植、微生物活性研究或活菌培养,则推荐使用保护剂。
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添加比例:常见为按1:5(粪便:保护液, w/v)悬浮后分装冻存。
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收集粪便后立即称重,记录每个样本的原始湿重(如200 mg)。
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按设定比例(如1:5)加入PBS+甘油混匀。
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记录总体积或总质量后等量分装冻存。
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解冻后按已知稀释比例计算所需体积。
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或在冻存前留取一份不加甘油样本,备用称重。
关于大鼠粪便长期(约6个月)冷冻保存以用于后续制备粪便混悬液的策略,需根据实验目的(如是否用于微生物移植、宏基因组测序或代谢组学等)决定保存方式。以下结合常规实践及样本质量控制要求,分点分析:
一、冷冻保存策略比较
1、直接-80°C冷冻(不添加保护剂)
2、加入保护剂(常用PBS + 10–20%甘油)后冻存
二、若加入甘油+PBS,如何准确称取粪便质量
若冻存前已混匀于甘油/PBS中,则无法直接称量粪便质量,建议如下操作路径:
1、推荐方法:预称量干粪法
2、后续使用
3、替代策略:标准稀释浓度保存
也可统一按“X mg粪便 / mL保护液”方式预设浓度保存,避免每次称量。
三、建议总结
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保存方式 |
是否便于称重 |
适用情境 |
|---|---|---|
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直接-80°C冻存 |
是 |
代谢组学、DNA提取等 |
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加甘油+PBS冻存 |
否(需预称) |
粪菌移植、活菌研究、菌群培养 |
四、操作建议(若用于后续制备粪便混悬液)
1、如仅分析微生物组成(如16S/宏基因组等)或代谢产物,可直接-80°C冻存。
2、若考虑活性移植或保留菌群活性,应加甘油(10–20% v/v)和PBS,按比例稀释。
3、冻存前务必称重并记录原始粪便质量,便于后续定量和数据归一。
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