请问发酵液放-20℃一段时间还能送扩增子吗?

    是否还能用于扩增子测序,需根据以下几个核心因素判断:

    一、发酵液保存状态与冻存时间

    • -20℃保存通常无法完全抑制微生物酶活性,尤其在反复冻融或保存超过数周后,DNA可能出现降解;

    • 若只是短期保存(<1周)且冻存过程迅速、无反复冻融,仍有较大概率可以进行后续提取与扩增;

    • 若保存时间较长(>2周)或样品曾经历多次解冻,则需先评估DNA完整性。

    二、是否含甘油或保护剂

    • 若发酵液加入了甘油或其他冷冻保护剂,细胞结构相对稳定,冻存对微生物DNA影响相对较小;

    • 但若直接冻存未加保护剂,细胞在冻结过程中可能裂解,释放的核酸易受降解酶影响。

    三、建议操作与质量评估

    建议在送扩增子前执行以下步骤:

    1、取样提取DNA(常用微生物基因组提取试剂盒);

    2、检测DNA浓度与完整性:

    • 使用Nanodrop或Qubit评估浓度;

    • 使用琼脂糖凝胶判断是否存在明显降解;

    3、如DNA浓度低或降解严重,不建议直接送扩增子建库。

    四、补充建议

    1、若时间允许,建议重新接种培养再取样,保证样品质量;

    2、后续若需长期保存发酵液用于分子实验,建议:

    • 加入甘油至最终20%,-80℃保存;

    • 或直接提取DNA后保存于-20℃/-80℃备用。

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    相关服务:

    16S/18S/ITS扩增子测序

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