请问在高分辨质谱分子量鉴定中，去卷积需要用到什么软件?

高分辨质谱（High-Resolution Mass Spectrometry, HRMS）数据中进行分子量鉴定时，去卷积（Deconvolution）是关键步骤，特别适用于多电荷离子谱（如蛋白、抗体、肽段等）的分析。常用去卷积软件根据平台和需求有所不同，分类如下：

 

一、商业软件（配套硬件）

 

软件名称	适用平台	特点
BioPharma Finder	Thermo	支持蛋白、抗体等复杂样品；去卷积+ PTM 分析
MaxEnt 1/3 (MassLynx)	Waters	适合精确质量分析与蛋白质谱去卷积
Compass DataAnalysis + Protein Deconvolution	Bruker	适用于ESI TOF数据，支持Lacos算法
Agilent MassHunter BioConfirm	Agilent	针对蛋白质、ADC、小分子等的分子量确认

 

二、通用/独立软件

 

软件名称	特点	适用类型
UniDec	免费、支持多种数据格式（Thermo RAW、mzML等）；处理速度快，适合单体、寡聚体、复合物等蛋白质去卷积	蛋白质、多电荷大分子
MS-Deconv (TopPIC suite)	针对Top-Down谱图，支持未知修饰识别	Top-down proteomics
Xtract / ReSpect	Thermo Xcalibur中的内建算法	自动进行谱图去卷积

 

三、操作建议

1、小分子质谱：通常不需要复杂去卷积，直接从同位素分布或单电荷峰即可确定精确质量；

2、蛋白质、抗体：建议使用 UniDec 或仪器厂商配套软件；

3、数据格式转换：非厂商软件通常需先将 RAW 转换为 mzML（可用 ProteoWizard 的 MSConvert 工具）；

4、参数优化关键点：需合理设置电荷范围、质量范围、分辨率参数，避免虚假峰出现。

 

百泰派克生物科技--生物药物表征，多组学生物质谱检测优质服务商

 

相关服务：

高分辨质谱分子量鉴定