SUMO相关实验通常如何设计?若采用Western Blot,应选择哪类抗体?实验体系可以自行构建吗?
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目的:观察细胞/组织中SUMO化动态变化,如应激、药物处理等条件下。
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方法:Western blot 检测整体SUMO化蛋白谱;常用SUMO1、SUMO2/3抗体检测Smear(拖尾)信号。
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目的:验证某一蛋白是否被SUMO化,或识别具体修饰位点。
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方法:Co-IP + WB 或 Ni-NTA拉下 + WB 检测SUMO化形式,配合突变体(如K→R)验证修饰位点。
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目的:研究SUMO化调控机制。
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方法:基因敲除/过表达SAE1/2、UBC9、PIAS家族等SUMO酶类,观察底物修饰变化。
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目的:观察SUMO化对蛋白功能的影响。
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方法:GFP融合蛋白+突变体(WT vs SUMO-deficient),配合共聚焦显微镜、转录活性检测等手段。
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表达His-SUMO1/SUMO2/3融合蛋白,有利于Ni-NTA拉下富集SUMO化蛋白;
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搭配目标蛋白Flag-tag表达,进行SUMO化验证;
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推荐在SUMO酶完整表达的细胞中进行实验,如HEK293T。
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SUMO融合蛋白需具备活性结构(建议保留Gly-Gly末端);
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构建K-R突变体作为阴性对照,验证特异性;
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表达量需适中,避免非生理性过表达导致伪影。
针对SUMO(Small Ubiquitin-like Modifier)修饰的研究,实验设计需根据具体研究目的(如:是否关注全局SUMO化、特定位点修饰、或特定底物蛋白)做精确区分。以下分层说明:
一、常见SUMO相关实验设计策略
1、总SUMO化水平检测
2、特定位点/特定底物蛋白的SUMO化检测
3、SUMO E1/E2/E3酶系统干预实验
4、细胞定位与功能实验
二、Western Blot抗体选择
1、抗-SUMO抗体(用于检测整体SUMO化)
(1)Anti-SUMO1:用于检测特异性SUMO1修饰(常参与核内调控)。
(2)Anti-SUMO2/3(共交叉反应):识别SUMO2与SUMO3修饰(通常在应激反应中快速上调)。
建议选择经验证具备Smear检测能力的抗体,如Cell Signaling、Abcam、Enzo等品牌的WB-validated抗体。
2、抗目标蛋白抗体
若研究特定底物蛋白的SUMO化,需搭配该蛋白的特异性抗体,在IP或WB中使用。
3、标签抗体(His、Flag、HA)
在使用标签蛋白(如His-SUMO)进行纯化或共表达时常用。
三、实验体系构建建议
1、可自行构建稳定或瞬时表达体系
2、表达构建注意事项
3、E3酶可联合共转染增强特异性SUMO化
如PIAS1、PIASy共表达增强某些靶蛋白SUMO化。
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