有哪些胶内酶切后进行质谱定量方法的经典相关文献推荐？

胶内酶切后进行质谱定量的方法在蛋白质组学研究中得到了广泛应用。以下是一些关于这个方法的经典和相关文献，以供参考：

 

一、Shevchenko, A., Tomas, H., Havlis, J., Olsen, J. V., & Mann, M. (2006). In-gel digestion for mass spectrometric characterization of proteins and proteomes. Nature Protocols, 1(6), 2856-2860.

链接：https://www.nature.com/articles/nprot.2006.468

这篇文献详细描述了将蛋白质在SDS-PAGE胶中酶切，然后通过质谱进行表征的方法。这是一个经典的方法论文，为后续研究提供了基础。

 

二、Wisniewski, J. R., Zougman, A., Nagaraj, N., & Mann, M. (2009). Universal sample preparation method for proteome analysis. Nature Methods, 6(5), 359-362.

链接：https://www.nature.com/articles/nmeth.1322

这篇文章介绍了一种通用的蛋白质组样品处理方法，其中包括在胶内进行酶切。这个方法的优点是可以同时提取、纯化和酶切蛋白质，从而简化了整个流程。

 

三、Cox, J., & Mann, M. (2008). MaxQuant enables high peptide identification rates, individualized p.p.b.-range mass accuracies and proteome-wide protein quantification. Nature Biotechnology, 26(12), 1367-1372.

链接：https://www.nature.com/articles/nbt.1511

这篇文章描述了一种用于蛋白质定量的软件工具MaxQuant。MaxQuant可以处理胶内酶切后产生的质谱数据，实现高灵敏度和准确度的蛋白质鉴定和定量。

 

以上文献提供了关于胶内酶切和质谱定量方法的一些基本信息。根据研究需求，可以选择使用这些方法，并结合其他蛋白质组学技术（如标记法或标记自由定量法）进行定量研究。

 

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