请问怎么根据多肽氨基酸的序列计算氨基酸组成特征、二肽组成特征以及伪氨基酸组成特征？

一、氨基酸组成（Amino Acid Composition, AAC）

1、原理

统计序列中20种标准氨基酸的相对频率。

 

2、计算公式

 



图1

 

二、二肽组成（Dipeptide Composition, DPC）

1、原理

统计所有400种可能的二肽（AA, AC, ..., YY）的频率，捕捉氨基酸的局部顺序信息。

 

2、计算公式

 



图2

 

三、伪氨基酸组成（Pseudo Amino Acid Composition, PseAAC）

1、原理

在AAC基础上引入氨基酸理化性质（如疏水性、极性、侧链质量等）和序列顺序相关信息，常用于机器学习建模。

 

2、基本形式（Type I）

 



图3

 

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