PLS-DA/OPLS-DA二维图的Q2 ，还有R2y 在哪里看啊？

在使用PLS-DA（偏最小二乘判别分析）或 OPLS-DA（正交偏最小二乘判别分析）分析后，Q² 和 R²Y 是两个非常关键的模型评估指标，它们通常用于判断模型的拟合程度和预测能力。

 

一、在进行PLS-DA或OPLS-DA分析后，Q² 和 R²Y 是评估模型性能的两个核心指标

1、R²Y 表示模型对分类变量（Y）的拟合程度。

2、Q² 表示模型的预测能力，通常通过交叉验证获得。

 

二、你可以在不同的软件中找到它们的位置

1、SIMCA：在模型建立后，直接在“Model Overview”或“Scores Plot”界面右下角即可看到R²Y和Q²值。

2、MetaboAnalyst：完成分析后，在“Model Evaluation”或“Validation”模块查看，Q²和R²Y会以数值和图示形式展示。

3、R（ropls包）：使用summary(model)命令，控制台会输出R2Y和Q2。

4、Python（如用sklearn）：需要手动通过预测结果计算Q²（如交叉验证）和R²Y。

 

这两个参数通常不会直接标注在二维得分图（score plot）上，而是在模型摘要或结果输出中查看。

 

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