WB蛋白不加Loading,也没有加蛋白酶抑制剂,直接放-80是不是就降解了呀?
是的,这种情况下蛋白很可能已经部分降解了,具体分析如下:
一、没有加 Loading Buffer(上样缓冲液)
Loading buffer(通常含 SDS、甘油、DTT/BME、溴酚蓝等)有以下作用:
1、变性蛋白、保持线性结构
2、抑制蛋白酶活性(部分靠高浓度 SDS 和还原剂)
3、减缓降解过程
不加 Loading buffer,蛋白酶可能在冰冻前仍然活跃,尤其是在样品离心、裂解之后,蛋白酶暴露的情况下。
二、没有加蛋白酶抑制剂
细胞裂解后内源性蛋白酶会快速激活,若无蛋白酶抑制剂,蛋白在短时间内就可能降解。
三、直接放 -80°C 冷冻
虽然 -80°C 可以抑制大多数酶活性,但冷冻速度不是瞬间的,在冻结过程中(尤其是从室温或冰上到 -80°C 的这段时间)蛋白酶仍有活性,会发生一定程度的降解。
四、可能后果
1、蛋白总量减少,尤其是易降解的目标蛋白
2、WB上目标条带变弱甚至消失
3、出现非特异降解条带或 smear(拖尾)
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