蛋白质加了loadingbuffer煮样跑page会因为高温变性导致蛋白降解吗?
在SDS-PAGE实验中,蛋白加了Loading Buffer并经过高温变性,主要目的是使蛋白质完全变性、解聚和去除二硫键,从而获得均一的电泳迁移行为。但在这个过程中,大多数蛋白不会降解,因为SDS、DTT(或β-巯基乙醇)等变性剂只会破坏蛋白的二级、三级结构,使其线性化,而不会直接降解主链(肽键)。
某些蛋白质可能会降解,主要是以下几个因素导致:
(1)蛋白本身不稳定:某些蛋白对高温特别敏感,如富含谷氨酰胺(Q)或天冬酰胺(N)的蛋白,可能发生高温水解或脱氨基作用。
(2)存在蛋白酶残留:如果样品中有蛋白酶未被彻底抑制,蛋白在加热过程中可能仍然被降解(如不加蛋白酶抑制剂)。
(3)样品浓度过低:低浓度蛋白在高温下更容易水解或氧化,特别是在没有足够SDS和DTT保护的情况下。
如何避免蛋白降解
(1)合理控制温度和时间:一般推荐 95℃,5-10 min。
(2)添加蛋白酶抑制剂:在裂解和样品准备过程中添加蛋白酶抑制剂(如PMSF、蛋白酶抑制剂cocktail),减少降解风险。
(3)检查SDS和还原剂:确保SDS和DTT(或β-巯基乙醇)浓度充足以保证完全变性,防止蛋白聚集。
(4)避免反复冻融:蛋白样品如果反复冻融也可能导致降解,建议储存于-80℃并尽量减少冻融次数。
(5)使用新鲜的样品缓冲液,确保pH合适(6.8-8.0),避免因pH失调导致的蛋白化学降解。
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