请问肠道内容物在-20保存会影响非靶代谢和靶向代谢结果吗?
在肠道内容物的代谢组学研究中,样本保存温度对非靶向代谢和靶向代谢的结果有显著影响。以下是关于-20°C保存条件对代谢组学分析影响的详细解答:
一、保存温度对代谢物稳定性的影响
1、-80°C:是代谢组学样本保存的标准温度,极低温可以最大程度地减少代谢物的降解和转化,保证代谢组学数据的准确性。
2、-20°C:虽然在短期(如几天到一周)内可以基本保持样本的完整性,但长期保存(超过两周)可能导致一些代谢物发生降解或转化,尤其是一些对温度敏感的小分子代谢物(例如某些脂质、氨基酸和酶活性相关代谢物)。
二、非靶向代谢与靶向代谢的影响
1、非靶向代谢(Untargeted Metabolomics)
(1)非靶向代谢组学旨在全面分析样本中尽可能多的代谢物,包括稳定和不稳定的分子。
(2)在-20°C下保存时,某些代谢物(如短链脂肪酸、有机酸、某些氨基酸)可能降解或氧化,导致代谢物谱发生偏移。
(3)结果可能表现为一些代谢物信号减弱或消失,从而影响代谢组学数据的整体质量和可重复性。
2、靶向代谢(Targeted Metabolomics)
(1)靶向代谢组学专注于特定的代谢物,通常有标准品进行定量和验证。
(2)如果分析的靶向代谢物是温度敏感型分子(例如某些脂质类、短链脂肪酸、核苷酸类物质),在-20°C保存时可能会发生降解,影响定量结果。
(3)但是对于相对稳定的代谢物(例如某些氨基酸、糖类),-20°C在短期内可能不会有显著影响。
三、保存时间的影响
1、短期保存(<1周): 对大多数代谢物的影响较小。
2、中期保存(1-4周): 部分温度敏感代谢物开始降解,尤其是酶促反应相关代谢物。
3、长期保存(>1个月): 代谢物降解、氧化和细菌或酶活性带来的变化将显著增加,显著影响代谢组学结果。
四、建议
1、首选-80°C保存
长期保存肠道内容物样本,建议使用-80°C冷冻。
2、短期保存可用-20°C
如果样本只保存几天到一周,用-20°C保存对大部分代谢物影响不大。
3、添加保护剂
一些代谢物可以通过添加抗氧化剂或代谢抑制剂(如甲醇、乙腈等)减少降解。
4、速冻保存
样本应尽快冷冻,避免反复冻融,以减少酶促反应和降解。
5、数据校正
在数据分析时,应考虑保存温度带来的批次效应,并在统计分析中进行校正。
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