蛋白质相互作用数据库有哪些

    蛋白质-蛋白质相互作用数据库主要记录了通过实验验证的蛋白质相互作用信息。以下为大家介绍一些主要的蛋白质-蛋白质相互作用数据库:

     

    1. BioGRID (Biological General Repository for Interaction Datasets): BioGRID是一个专注于生物分子相互作用的数据库,包括蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA以及其他多种类型的相互作用数据。

    2. DIP (Database of Interacting Proteins): DIP是一个记录已知蛋白质相互作用的数据库,旨在为生物分子复合物的结构和功能研究提供支持。它包含通过实验验证的相互作用。

    3. IntAct:IntAct是由欧洲生物信息研究所(EBI)维护的一个开放源代码的蛋白质相互作用数据库。它提供详细的蛋白质相互作用信息,包括实验条件和方法。

    4. MINT:分子相互作用数据库,注重实验验证的蛋白质相互作用。

    5. STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins): STRING数据库提供关于蛋白质和其预测相互作用的广泛信息。这包括直接(物理)和间接(功能)联系,涵盖来源广泛的数据,包括实验数据、计算预测、共表达网络以及文献中的文本挖掘结果。

    6. BIND:存储蛋白质、化合物和二聚体的相互作用。

    7. HPRD:人源蛋白质参考数据库,专注于包括细胞位置、表达、蛋白质相互作用、磷酸化位点和疾病关联等信息。

    8. HPIDb (Host-Pathogen Interaction Database): HPIDb专注于宿主与病原体之间的蛋白质-蛋白质相互作用。

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    图1. 百泰派克蛋白质相互作用分析

     

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    蛋白质相互作用质谱分析

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